Jänkäsalon asutuksella on pitkä historia. Saari on ollut asuttuna jo satoja vuosia.
Viime vuosisadan alkupuolella, jolloin liikuttiin vesiteitä pitkin, Jänkäsalo oli vireimpiä Taipalsaaren kunnan asuinalueita. Saaressa oli silloin toista sataa asukasta.
Yhteiskunnan elinkeinorakenteen ja liikenneyhteyksien muututtua saari lähes autioitui ja jäi eristykseen muusta kunnasta, kunnes vuonna 2005 Suureen Jänkäsaloon saatiin lossiyhteys ja sähköt. Yhteyksien parannuttua toiminta saaressa on jälleen vilkastunut ja vakituisten asukkaiden ja kesäasukkaiden määrä on lisääntynyt. Rakentamattomista tonteista ja myytävistä tiloista on suuri kysyntä.